يهدف مكتب المراجعة الداخلية الى التحقق من طبيعة السياسات المالية والادارية المرسومة إذ تعتمد إدارة المركز على المراجعة الداخلية في كشف الحقائق  وتقييم الاداء والوصول المبكر لمواطن الخلل والانحرفات ، وتدني مستوى الاداء و المحافظة على اصول المركز وممتلكاته ، و ضمان تحقيق أهداف المركز والاغراض التي انشيء من ظاجلها ، و أكتشاف حالات الغش والتلاعب ومنع حدوثها .

ويختص بما يلــــي :  

1. مراجعة كافة الحسابات وأدونات الصرف والتأكد من توفر واستيفاء كافة المستندات وفقاً للقوانين واللوائح المالية النافذة .
2. مراجعة الاجراءات الخاصة بعمليات الشراء و أوامر الشراء وأوامر التكليف بتنفيذ الاعمال .
3. مراجعة حسابات الخزائن ايرادا ًوصرفاً .
4. مراجعة الاجراءات الخاصه بالأعتمادات المستندية ويدخل في ذلك إجراءات فتح الاعتمادات  وتعديلاتها  وتحديد صلاحيتها .
5. مراجعة الصرف من العهد المستديمة و أستعاضتها والتحقق من المستندات المرفقة والتأكد من الألتزام بحدود الصرف حسب ما تنص عليه اللوائح  المالية .
6. مراجعه كشوفات  واسثمارات  المرتبات و التحقق من صحة بياناتها .
7. التحقق من تطبيق القوانين واللوائح والقرارات الخاصة بالمرتبات والمكافأت والبدلات و الاستقطاعات  القانونية .
8. التحقق من سلامة التوجيهات  المحاسبية لبنود الانفاق  والايرادات .
9. مراجعة عمليات  القيود و الترحيل  لكافة الدفاتر و السجلات المستخدمة و التحقق من صحة العقود .
10. إجراء عمليات الجرد المفاجيء على التغذية بالخزائن وعلى البضاعة بالمخازن وأثبات ذلك  بمحضر الجرد .
11. إعداد التقارير الدورية عن نشاط  المركز .
12. أية  أعمال أخرى تسند للمكتب في إطار أختصاصاته .