ويختص بما يلــــي: 

1. القيام بتنفيذ اللوائح الصحية الدولية في ليبيا بأقصى جهد ممكن.
2. إرشاد كافة الوحدات الإدارية والجهات الأخرى المعنية باللوائح الصحية الدولية 2005 وأخذ التدابير المحددة وفق ما يتم الإعلان عنه من قبل منظمة الصحة الدولية.
3. تنفيذ التوجيهات الواردة باللوائح الصحية الدولية التي تكون ليبيا طرفاً فيها بالتنسيق مع الأطراف المعنية.
4. المشاركة في أعمال تنفيذ اللوائح الصحية الدولية مع الجهات ذات العلاقة محلياً ودوليا.
5. مساعدة المجتمع على توقي ومواجهة المخاطر الصحية العمومية القادرة على الانتشار عبر الحدود وتهديد الناس في شتى أرجاء البلاد.
6. تعزيز القدرات في مجال ترصد الأخطار الصحية العمومية ومواجهتها من أجل رصد وإبلاغ ومواجهة الأحداث الصحية العمومية.
7. التواصل والتنسيق بين المركز الوطني لمكافحة الامراض والشركاء المحليين والدوليين وفقاً للوائح الصحية الدولية 2005م وجميع الجهات ذات العلاقة في الدولة للاستجابة في حالة طوارئ الصحة العامة.
8. توجيه كافة الوحدات الإدارية والجهات الأخرى المعنية بالتزام وأخذ التدابير المحددة وفق ما يتم الإعلان عنه والتي ينبغي اتخاذها في الموانئ والمطارات والمعابر البرية من أجل الحد من انتشار المخاطر الصحية من وإلى البلدان المجاورة، وإرشاد الحكومة لمنع فرض القيود غير المبررة على السفر والتجارة من أجل الحد من تعطل حركة المرور والتجارة إلى أدنى قدر ممكن.
9. إدارة القدرات والإنذار والاستجابة على مستوى الدولة.
10. التعاون مع المنظمات والهيئات المحلية والدولية في سبيل أداء مهامه المناطة به بإذن التقسيم الإداري المختص بالمركز ووفقا للتشريعات النافذة
11. إعداد التقارير الدورية عن نشاط وعمل المكتب
12. أي مهام أخرى تسند للمكتب.