وتختص بالآتي:

1. الإشراف على البرنامج الوطني للتطعيم والبرامج الملحقة به.
2. الاشتراك في اللجان الفنية في مجال التخصص.
3. اقتراح تدريب جميع أعضاء شبكات التطعيم على أداء أعمالها.
4. الإشراف على ما يتعلق بحفظ التطعيم واقتراح مواصفات مراكز التطعيم وآليات العمل الخاصة بها وتحديد متطلبات الإمداد الخاص بالتطعيمات والإشراف الفني على كافة مواقع التطعيم.
5. الإشراف والمتابعة لحفظ الطعوم والإشراف على صيانة معدات وأجهزة الدائرة الباردة بالتنسيق مع الجهات المعنية ووضع وتنفيذ الخطة التدريبية لها.
6. تنظيم قواعد حركة صرف الطعوم واقتراح فترات التوريد بالتنسيق مع الجهات ذات العلاقة.
7. القيام بحملات التطعيم كلما دعت الضرورة لذلك.
8. اقتراح تعديل جداول التطعيم وتحديثها
9. إعداد التقارير الخاصة بأعمال الإدارة.
10. تنظيم قواعد حركة صرف الطعوم واقتراح فترات التوريد بالتنسيق مع الجهات ذات العلاقة
11. الإعداد والإشراف على منظومات التطعيم.
12. تحديد احتياجات الإدارة من المواد والمعدات والآليات والأدوية والأجهزة ومستلزمات العمل.
13. المشاركة في اعداد الاحتياج السنوي للتطعيمات الموسمية والاستثنائية وتطعيمات الحملات.
14. أي مهام أخرى تسند للإدارة

وتمارس الإدارة اختصاصها خلال الأقسام التالية:

 قسم تدابير التطعيم ويختص بما يلــــي: – 

1. الإشراف على البرامج الملحقة بالتطعيم.
2. الاشتراك في اللجان الفنية في مجال التخصص.
3. اقتراح تدريب جميع أعضاء شبكات التطعيم على أداء أعمالها
4. اقتراح المواصفات الفنية مراكز التطعيم وآليات العمل الخاصة بها.
5. تحديد متطلبات الإمداد الخاص بالتطعيمات والإشراف الفني على كافة مواقع التطعيم.
6. القيام بحملات التطعيم كلما دعت الضرورة لذلك
7. اقتراح الوثائق الخاصة بالتطعيم.
8. إعداد التقارير الخاصة بأعمال القسم.
9. الإعداد والإشراف على منظومات التطعيم.
10. تحديد احتياجات الإدارة من المواد والمعدات والآليات والأدوية والأجهزة ومستلزمات العمل.
11. أي مهام أخرى تسند للقسم.

 قسم تدابير الطعم (الدائرة الباردة) ويختص بما يلــــي: – 

1. الاشتراك في اللجان الفنية في مجال التخصص.
2. الإشراف والمتابعة لحفظ الطعوم.
3. الإشراف على صيانة معدات وأجهزة الدائرة الباردة
4. التنسيق مع الجهات المعنية في تنفيذ الخطة التدريبية لها.
5. تنظيم قواعد حركة صرف الطعوم واقتراح فترات التوريد بالتنسيق مع الجهات ذات العلاقة.
6. إعداد التقارير الخاصة بأعمال القسم.
7. تحديد احتياجات القسم من المواد والمعدات والآليات والأدوية والأجهزة ومستلزمات العمل.
8. أي مهام أخرى تسند للقسم.

 قسم بناء المناعة ويختص بما يلــــي: – 

1. اقتراح والتخطيط لحملات التطعيم بالتنسيق مع الجهات ذات العلاقة.
2. القيام بحملات التطعيم ومتابعتها.
3. الاشتراك في اللجان الفنية في مجال التخصص.
4. اقتراح الوثائق الخاصة بحملات التطعيم بالتنسيق مع قسم التطعيم.
5. إعداد التقارير الخاصة بأعمال القسم.
6. تحديد احتياجات القسم من المواد والمعدات والآليات والأدوية والأجهزة ومستلزمات العمل.
7. أي مهام أخرى تسند للقسم.

قسم الإحصاء والمعلومات ويختص بما يلــــي: – 

1. وضع الخطط والعمل على تنفيذها للوقاية والحد من انتشار الأمراض المكافحة بالتحصين بمشاركة الجهات ذات العلاقة.
2. تنفيذ البرامج التي تدخل ضمن اختصاص الإدارة والتي يتم إقرارها من الإدارة العامة للمركز واللجان العلمية.
3. المشاركة في الندوات والحلقات العلمية والدراسات والبحوث مع المنظمات والهيئات المحلية والدولية بالتنسيق مع التقسيم الإداري المختص بالمركز.
4. إعداد النماذج والسجلات الخاصة بالإدارة.
5. اقتراح والمشاركة في إعداد الدراسات والأبحاث والمسوحات المختلفة ذات العلاقة بعمل الإدارة.
6. الإشراف ومتابعة منظومة المعلومات الصحية الخاصة بالإدارة.
7. إعداد أرشيف خاص بكل الإصدارات المتعلقة باختصاص الإدارة في ليبيا.
8. جمع البيانات والمعلومات المتعلقة بمجال اختصاص الإدارة.
9. الإشراف على إعداد ومتابعة التقرير الصادرة عن الإدارة.
10. أي مهام أخرى تسند للقسم.