وتختص بالآتي:

1. القيام برصد الأمراض التي تدخل في اختصاص المركز.
2. إنشاء شبكات الرصد بمختلف المدن والمرافق الصحية بليبيا والإشراف عليها.
3. إبداء الرأي والمشورة في الأمور المتعلقة بالرصد الوبائي.
4. الإشراف على برامج الرصد الانتقائي والرصد العام والرصد الإفرادي وطرق الرصد والاستجابة السريعة.
5. الاشتراك في اللجان الفنية في مجال التخصص.
6. اقتراح تدريب جميع أعضاء شبكات الرصد على أداء أعمالها.
7. إعداد التقارير الخاصة بأعمال الإدارة.
8. الإعداد والإشراف على منظومات الرصد.
9. تحديد احتياجات الإدارة من المواد والمعدات والآليات والأدوية والأجهزة ومستلزمات العمل.
10. تبويب المعلومات الخاصة بالمركز وتقديمها في تقارير دورية.
11. إصدار النشرات الدورية على الوضع الوبائي للأمراض.
12. التعاون والتنسيق مع إدارة تقنية المعلومات بالمركز.
13. الاشتراك في الأنشطة والبرامج والندوات والمؤتمرات المتعلقة ببرامج الإحصاء الطبي وتحليل البيانات.
14. إعداد التقارير الدورية عن نشاط الإدارة.
15. أي مهام أخرى تسند للإدارة.

وتمارس الإدارة اختصاصها خلال الأقسام التالية

قسم الرصد والتقصي ويختص بما يلــــي: – 

1. القيام برصد الأمراض التي تدخل في اختصاص المركز.
2. إنشاء شبكات الرصد بمختلف المدن والمرافق الصحية بليبيا والإشراف عليها.
3. إبداء الرأي والمشورة في الأمور المتعلقة بالرصد الوبائي.
4. الإشراف على برامج الرصد الانتقائي والرصد العام والرصد الإفرادي.
5. الاشتراك في اللجان الفنية في مجال التخصص.
6. اقتراح تدريب جميع أعضاء شبكات الرصد على أداء أعمالها.
7. اقتراح خطط طوارئ واقتراح تشكيل لجان مواجهة الجوائح والأوبئة.
8. إعداد التقارير الخاصة بأعمال القسم.
9. الإعداد والإشراف على منظومات الرصد.
10. تحديد احتياجات القسم من المواد والمعدات والآليات والأدوية والأجهزة ومستلزمات العمل.
11. أي مهام أخرى تسند للقسم.

قسم الاستجابة السريعة ويختص بما يلــــي: –

1. الاشتراك في اللجان الفنية في مجال التخصص.
2. اقتراح تدريب فرق الاستجابة على أداء أعمالها.
3. اقتراح خطط طوارئ واقتراح تشكيل لجان وفرق مواجهة الجوائح والأوبئة.
4. إعداد التقارير الخاصة بأعمال القسم.
5. الإعداد والإشراف على منظومات الخاصة بالاستجابة السريعة.
6. تحديد احتياجات القسم من المواد والمعدات والآليات والأدوية والأجهزة ومستلزمات العمل.
7. أي مهام أخرى تسند للقسم.

قسم الإحصاء والمعلومات ويختص بما يلــــي: – 

1. المساعدة في وضع الخطط والعمل على تنفيذها للوقاية والحد من انتشار هذه الأمراض بمشاركة الجهات ذات العلاقة.
2. تنفيذ البرامج التي تدخل ضمن اختصاص الإدارة والتي يتم إقرارها في الإدارة العامة للمركز واللجان العلمية المختصة.
3. المشاركة في الندوات والحلقات العلمية والدراسات والبحوث مع المنظمات والهيئات المحلية والدولية في هذا المجال.
4. إعداد النماذج والسجلات الخاصة بالإدارة.
5. اقتراح والمشاركة في إعداد وإقرار الدراسات والأبحاث والمسوحات المختلفة ذات العلاقة بعمل الإدارة.
6. الإشراف ومتابعة منظومة المعلومات الصحية الخاصة بالإدارة.
7. إعداد أرشيف خاص بكل الإصدارات المتعلقة باختصاص الإدارة في ليبيا.
8. جمع البيانات والمعلومات المتعلقة بمجال اختصاص الإدارة.
9. الإشراف على إعداد ومتابعة التقارير الصادرة عن الإدارة.
10. أي مهام أخرى تسند للقسم.